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辞退员工工资补偿标准是按照应发工资计算。
在法律规定中，经济补偿的月工资按照劳动者应得工资计算。应发工资是指劳动者在提供了正常劳动的情况下，按照劳动合同约定的工资标准应当获得的全部劳动报酬，包括了基本工资、奖金、津贴、补贴等货币性收入。而实发工资是在应发工资的基础上，扣除了社保费用、个人所得税等项目后实际拿到手的工资。
依据《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条，劳动合同法第四十七条规定的经济补偿的月工资按照劳动者应得工资计算，包括计时工资或者计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入。劳动者在劳动合同解除或者终止前12个月的平均工资低于当地最低工资标准的，按照当地最低工资标准计算。劳动者工作不满12个月的，按照实际工作的月数计算平均工资。
以应发工资作为计算经济补偿的标准，具有合理性。应发工资能够更全面地反映劳动者的劳动价值和收入水平。奖金、津贴等都是劳动者劳动成果的一部分，将其纳入计算范围，体现了对劳动者整体劳动贡献的尊重和补偿。社保费用和个人所得税等扣除项目，是基于国家法律法规的规定进行的，并非劳动者实际劳动收入的减少。如果以实发工资计算经济补偿，会导致劳动者的补偿金额降低，损害了劳动者的合法权益。
例如，某员工月应发工资为8000元，扣除社保和个税等后实发工资为7000元。在计算辞退经济补偿时，应以8000元为基数进行计算，而不是7000元。这样才能保障劳动者在被辞退时获得合理的经济补偿，维护其合法权益。
法律依据：
《中华人民共和国劳动合同法》 第四十七条
经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
本条所称月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
