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个人认定工伤和单位认定工伤在申请主体、申请时间、所需材料、举证责任等方面存在区别。
申请主体方面，单位认定工伤是由用人单位作为主体向相关部门提出申请；而个人认定工伤是受伤职工或者其近亲属、工会组织作为申请主体。
申请时间不同。职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。用人单位未按前款规定提出工伤认定申请的，工伤职工或者其近亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
所需材料上也有差异。单位申请时通常是常规的申请表、劳动关系证明、医疗机构诊断证明等材料。个人申请时，除这些基本材料外，可能还需要额外提供用人单位的营业执照复印件等能证明单位主体资格的材料，并且在用人单位未申请的情况下，要说明未申请的原因。
举证责任方面，单位申请工伤认定时，对于职工是否属于工伤的举证责任相对更重。因为单位对职工的工作情况、事故发生过程等有更深入的了解和掌握。而个人申请工伤认定时，虽然也需要提供一定证据，但在一些情况下，如果用人单位不认为是工伤的，由用人单位承担举证责任。
从维护权益的角度看，单位申请工伤认定是其法定义务，如果单位不及时申请，在此期间发生符合规定的工伤待遇等有关费用由该用人单位负担。而个人申请则是在单位不作为时保障自身权益的重要途径。
法律依据：
《中华人民共和国刑事诉讼法》 第三条
对刑事案件的侦查、拘留、执行逮捕、预审，由公安机关负责。检察、批准逮捕、检察机关直接受理的案件的侦查、提起公诉，由人民检察院负责。审判由人民法院负责。除法律特别规定的以外，其他任何机关、团体和个人都无权行使这些权力。
