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电子税务局注销公司一般流程为登录电子税务局、进入注销套餐、完成各项业务预检、处理未办结事项、提交注销申请，待税务机关审核通过后，即完成税务注销。
登录电子税务局。纳税人需要在浏览器中打开当地电子税务局的官方网站，通过账号和密码登录系统。不同地区的电子税务局登录方式可能略有不同，部分地区还支持使用 CA 证书、电子营业执照等方式登录。
进入注销套餐：登录成功后，在电子税务局首页搜索栏输入“注销”，找到“清税注销税（费）申报及缴纳套餐”或类似功能模块并点击进入。该套餐将纳税人需要办理的各类注销业务进行整合，方便纳税人一次性完成多项操作。
预检未办结事项：进入注销套餐后，系统会自动对纳税人的税务登记、纳税申报、发票使用、税款缴纳等情况进行预检，列出存在的未办结事项。这些未办结事项可能包括未申报的税种、未缴纳的税款、未验旧的发票等。纳税人需要仔细查看这些未办结事项，并按照系统提示进行处理。
处理未办结事项：对于未申报的税种，纳税人需要在电子税务局中完成相应的申报。对于未缴纳的税款，纳税人可以通过电子税务局的网上缴款功能进行缴纳。对于未验旧的发票，纳税人需要在电子税务局中进行发票验旧操作。如果纳税人在处理未办结事项过程中遇到问题，可以拨打当地税务机关的咨询热线或前往办税服务厅寻求帮助。
提交注销申请：当所有未办结事项处理完毕后，纳税人可以在注销套餐中提交注销申请。系统会生成《清税申报表》或《注销税务登记申请审批表》，纳税人需要仔细核对表中的信息，确认无误后点击“提交”按钮。税务机关会对纳税人的注销申请进行审核，审核结果将通过电子税务局反馈给纳税人。
领取清税证明：如果税务机关审核通过纳税人的注销申请，纳税人可以在电子税务局中下载《清税证明》。《清税证明》是纳税人完成税务注销的重要凭证，纳税人需要妥善保管。
法律依据：
《中华人民共和国税收征收管理法》 第十六条
从事生产、经营的纳税人，税务登记内容发生变化的，自工商行政管理机关办理变更登记之日起三十日内或者在向工商行政管理机关申请办理注销登记之前，持有关证件向税务机关申报办理变更或者注销税务登记。
