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公司变更股东时部分股东不签字，可通过查看公司章程规定、协商沟通、法律途径等方式解决。
在公司运营过程中，变更股东是常见的事项，但有时会遇到部分股东不签字的情况。需要查看公司章程的相关规定。公司章程是公司的“宪法”，其中可能对股东变更的程序和表决方式有明确约定。如果章程规定了变更股东只需一定比例的股东同意即可，那么在达到该比例的情况下，即使有部分股东不签字，变更仍可按照章程规定的程序进行。
若公司章程没有特别规定，那么可以尝试与不签字的股东进行协商沟通。了解其不签字的原因，有可能是对变更事项存在误解或者有其他合理诉求。通过友好协商，向其解释变更的必要性和对公司发展的积极意义，争取达成一致意见。例如，可以提供详细的财务分析和业务规划，让不签字的股东看到变更对公司和全体股东的长远利益。
如果协商沟通无法解决问题，还可以考虑法律途径。根据《中华人民共和国公司法》等相关法律法规，股东的合法权益受法律保护，但同时也需要遵守法律和公司章程的规定。如果不签字的股东无正当理由阻碍公司正常的股东变更程序，其他股东可以向人民法院提起诉讼，请求法院判决支持公司的股东变更决议。在诉讼过程中，需要提供充分的证据证明变更事项符合法律和公司章程的规定，以及不签字股东的行为对公司造成了不利影响。
另外，需要注意的是，在整个处理过程中，要严格按照法律和公司章程的规定进行操作，确保程序的合法性和合规性。同时，要尽量避免对公司的正常运营造成过大的影响，维护公司的稳定发展。总之，公司变更股东遇到部分股东不签字的情况，要根据具体情况采取合适的解决措施，以保障公司和股东的合法权益。
法律依据：
《中华人民共和国公司法》 第一百七十九条
公司合并或者分立，登记事项发生变更的，应当依法向公司登记机关办理变更登记；公司解散的，应当依法办理公司注销登记；设立新公司的，应当依法办理公司设立登记。
公司增加或者减少注册资本，应当依法向公司登记机关办理变更登记。
第四十三条
股东会的议事方式和表决程序，除本法有规定的外，由公司章程规定。
股东会会议作出修改公司章程、增加或者减少注册资本的决议，以及公司合并、分立、解散或者变更公司形式的决议，必须经代表三分之二以上表决权的股东通过。
