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商品房合同无效时，担保合同通常也无效。担保合同被确认无效后，需根据各方过错承担相应责任，一般无需专门办理常规意义上的“手续”，而是涉及责任认定、赔偿协商或诉讼等事宜。
依据《中华人民共和国民法典》规定，担保合同是主债权债务合同的从合同，主债权债务合同无效的，担保合同无效，但是法律另有规定的除外。在商品房交易中，商品房买卖合同就是主合同，与之相关的担保合同为从合同。所以当商品房合同无效时，担保合同原则上也随之无效。
当担保合同被确认无效后，需要确定各方的过错责任。如果是因为开发商的原因导致商品房合同无效，比如开发商未取得预售许可证等，那么开发商可能存在主要过错。在这种情况下，对于因担保合同无效给担保人造成的损失，开发商应当承担赔偿责任。如果购房者也存在一定过错，比如明知开发商手续不全仍签订合同，那么购房者也需要根据自身过错程度承担部分责任。
关于具体处理，一般不需要专门去办理类似正常合同解除那样的手续。而是先由各方进行协商，就责任承担和赔偿事宜达成一致意见。比如，开发商退还购房者已支付的款项，同时对担保人因担保合同无效而遭受的损失进行赔偿。如果协商不成，任何一方都可以向人民法院提起诉讼，请求法院对各方过错责任进行认定，并判决相应的赔偿金额。在诉讼过程中，当事人需要提供相关证据来证明自己的主张，如商品房买卖合同、担保合同、付款凭证、开发商的违规行为证据等。法院会根据查明的事实和相关法律规定作出公正的判决。
如果担保合同涉及到登记等手续，在合同无效后，可能需要到相关登记部门办理注销登记等手续，以消除担保的法律状态。商品房合同无效后担保合同的处理，关键在于确定责任和解决赔偿问题，同时根据具体情况处理相关的登记等事宜。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》 第六百八十一条
保证合同是为保障债权的实现，保证人和债权人约定，当债务人不履行到期债务或者发生当事人约定的情形时，保证人履行债务或者承担责任的合同。
第六百八十二条
保证合同是主债权债务合同的从合同。主债权债务合同无效的，保证合同无效，但是法律另有规定的除外。
保证合同被确认无效后，债务人、保证人、债权人有过错的，应当根据其过错各自承担相应的民事责任。
