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赔偿金超过12年的计算需根据不同情况确定。在经济补偿中，一般只有劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍时，支付经济补偿的年限才最高不超过十二年；若不存在此情况则按实际工作年限计算。而其他赔偿金计算需依据具体法律关系和相关规定。
首先来看经济补偿方面。根据《中华人民共和国劳动合同法》，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。这里存在特殊限制情况，当劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍时，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付经济补偿的年限最高不超过十二年。例如，当地上年度职工月平均工资为5000元，三倍就是15000元。若劳动者月工资为20000元，工作了15年，那么经济补偿就是15000×12 = 180000元。
但如果劳动者月工资未超过上述标准，就按实际工作年限计算经济补偿。比如劳动者月工资为8000元，在单位工作了15年，那么经济补偿就是8000×15 = 120000元。
除了劳动合同经济补偿外，还有其他类型的赔偿金。比如在侵权赔偿中，像人身损害赔偿，其赔偿金计算要综合考虑受害人的实际损失，包括医疗费、误工费、护理费、残疾赔偿金等。以残疾赔偿金为例，根据受害人丧失劳动能力程度或者伤残等级，按照受诉法院所在地上一年度城镇居民人均可支配收入或者农村居民人均纯收入标准，自定残之日起按二十年计算。但六十周岁以上的，年龄每增加一岁减少一年；七十五周岁以上的，按五年计算。这里的计算和工作年限没有直接关联，是根据受害人的年龄、伤残情况等因素确定。
再如违约赔偿，赔偿金的计算通常依据合同约定。如果合同约定了违约赔偿的计算方式，就按照合同来执行。若合同没有约定，则要根据违约造成的实际损失来确定赔偿金额，可能涉及到直接损失和可得利益损失等。所以，赔偿金超过12年的计算要根据具体的法律关系和相关规定来准确确定。
法律依据：
《中华人民共和国劳动合同法》 第四十八条
用人单位违反本法规定解除或者终止劳动合同，劳动者要求继续履行劳动合同的，用人单位应当继续履行；劳动者不要求继续履行劳动合同或者劳动合同已经不能继续履行的，用人单位应当依照本法第八十七条规定支付赔偿金。
