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质押的股权转让合同一般是有效的，但可能受到一定限制和存在特殊情况。
根据法律规定，合同生效通常需要满足行为人具有相应的民事行为能力、意思表示真实、不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗等条件。对于质押的股权转让合同，只要合同双方具备相应的民事行为能力，签订合同是双方真实的意思表示，且合同内容不违反法律法规的强制性规定和公序良俗，那么该合同在成立时一般是有效的。
不过，股权质押后进行转让会受到一些限制。依据《中华人民共和国民法典》第四百四十三条规定，以基金份额、股权出质的，质权自办理出质登记时设立。基金份额、股权出质后，不得转让，但是出质人与质权人协商同意的除外。出质人转让基金份额、股权所得的价款，应当向质权人提前清偿债务或者提存。也就是说，如果未经质权人同意，出质人擅自转让质押的股权，可能无法完成股权的过户登记手续，因为登记机关通常会要求提供质权人同意转让的相关证明。
如果出质人与质权人协商一致同意转让质押的股权，那么可以按照正常的股权转让程序进行，转让合同可以顺利履行。并且转让所得的价款，出质人应当向质权人提前清偿债务或者提存，以保障质权人的权益。
在司法实践中，如果因为质押的股权转让合同引发纠纷，法院会综合考虑合同的效力、质权人的权益、股权转让的实际情况等因素进行判断和处理。所以，虽然质押的股权转让合同可能有效，但在实际操作中需要遵循相关法律规定和程序，充分保障各方的合法权益。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》 第四百四十三条
以基金份额、股权出质的，质权自办理出质登记时设立。
基金份额、股权出质后，不得转让，但是出质人与质权人协商同意的除外。出质人转让基金份额、股权所得的价款，应当向质权人提前清偿债务或者提存。
《中华人民共和国民法典》 第四百四十条
债务人或者第三人有权处分的下列权利可以出质：
（一）汇票、本票、支票；
（二）债券、存款单；
（三）仓单、提单；
（四）可以转让的基金份额、股权；
（五）可以转让的注册商标专用权、专利权、著作权等知识产权中的财产权；
（六）现有的以及将有的应收账款；
（七）法律、行政法规规定可以出质的其他财产权利。
