合同诈骗罪立案后,处理流程一般包括侦查、审查起诉、审判三个主要阶段。
首先是侦查阶段。公安机关在立案后,会展开全面、深入的侦查工作。会对犯罪嫌疑人采取相应的强制措施,如拘传、取保候审、监视居住、拘留、逮捕等。对于犯罪嫌疑人,如果符合逮捕条件,公安机关会提请人民检察院批准逮捕。在侦查过程中,公安机关会收集与案件相关的各种证据,包括书证、物证、证人证言、犯罪嫌疑人的供述和辩解等。会对与合同诈骗有关的合同文本、资金流向、交易记录等进行调查核实。还会询问证人,了解案件发生的具体情况。经过侦查,认为犯罪事实清楚,证据确实、充分的,会写出起诉意见书,连同案卷材料、证据一并移送同级人民检察院审查决定。
其次是审查起诉阶段。人民检察院会对公安机关移送的案件进行全面审查。会讯问犯罪嫌疑人,听取辩护人、被害人及其诉讼代理人的意见,并记录在案。如果认为证据不足,人民检察院可以退回公安机关补充侦查,也可以自行侦查。补充侦查以二次为限。经过审查,人民检察院认为犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清,证据确实、充分,依法应当追究刑事责任的,会作出起诉决定,按照审判管辖的规定,向人民法院提起公诉。如果犯罪嫌疑人没有犯罪事实,或者有《刑事诉讼法》第十六条规定的情形之一的,人民检察院会作出不起诉决定。
最后是审判阶段。人民法院对提起公诉的案件进行审查后,对于起诉书中有明确的指控犯罪事实的,会决定开庭审判。在庭审过程中,会进行法庭调查、法庭辩论等环节。公诉人会在法庭上宣读起诉书,被告人可以自行辩护,也可以委托辩护人进行辩护。经过审理,人民法院会根据已经查明的事实、证据和有关的法律规定,作出判决。如果被告人不服一审判决,可以在法定期限内提出上诉,进入二审程序。二审判决为终审判决。

法律依据:
《中华人民共和国刑事诉讼法》 第一百一十二条
人民法院、人民检察院或者公安机关对于报案、控告、举报和自首的材料,应当按照管辖范围,迅速进行审查,认为有犯罪事实需要追究刑事责任的时候,应当立案;认为没有犯罪事实,或者犯罪事实显著轻微,不需要追究刑事责任的时候,不予立案,并且将不立案的原因通知控告人。控告人如果不服,可以申请复议。