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刑事案件轻微移交检察院后，检察院会根据具体情况进行审查，可能作出起诉或不起诉决定。若决定起诉，案件会进入法院审判阶段；若决定不起诉，诉讼程序即终结。
当轻微刑事案件移交检察院后，检察院首先会启动审查起诉程序。这一阶段，检察院会全面审查公安机关移送的案件材料，包括证据的真实性、合法性和关联性，犯罪事实是否清楚等。具体而言，检察院会讯问犯罪嫌疑人，听取辩护人、被害人及其诉讼代理人的意见，并记录在案。
对于轻微刑事案件，检察院可能作出以下两种决定。一是提起公诉。如果检察院认为犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，就会向人民法院提起公诉。在提起公诉时，检察院会制作起诉书，详细阐述犯罪事实、罪名以及适用的法律条款等内容。法院在受理后，会安排开庭审理，经过法庭调查、辩论等环节，最终作出判决。在这个过程中，犯罪嫌疑人有权委托辩护人进行辩护，维护自己的合法权益。
二是不起诉。根据法律规定，有几种情形检察院可能作出不起诉决定。例如，情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的；经特赦令免除刑罚的等。对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，检察院也可以作出不起诉决定。如果检察院作出不起诉决定，应当公开宣布，并且将不起诉决定书送达被不起诉人和他的所在单位。如果被不起诉人在押，应当立即释放。被害人如果不服，可以自收到决定书后七日以内向上一级人民检察院申诉，请求提起公诉，也可以直接向人民法院起诉。
此外，在审查起诉阶段，犯罪嫌疑人还可以通过积极赔偿被害人损失、赔礼道歉等方式，争取被害人的谅解，这在一定程度上可能会影响检察院的决定。同时，犯罪嫌疑人有权获得法律帮助，如果经济困难或者其他原因没有委托辩护人，本人及其近亲属可以向法律援助机构提出申请。
法律依据：
《中华人民共和国刑事诉讼法》 第一百七十七条
犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有本法第十六条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。
对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。
人民检察院决定不起诉的案件，应当同时对侦查中查封、扣押、冻结的财物解除查封、扣押、冻结。对被不起诉人需要给予行政处罚、处分或者需要没收其违法所得的，人民检察院应当提出检察意见，移送有关主管机关处理。有关主管机关应当将处理结果及时通知人民检察院。
《中华人民共和国刑事诉讼法》 第一百七十八条
不起诉的决定，应当公开宣布，并且将不起诉决定书送达被不起诉人和他的所在单位。如果被不起诉人在押，应当立即释放。
