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离婚时3个月宝宝一般会判给母亲直接抚养。
在司法实践中，对于离婚案件中子女抚养权的判定，遵循的原则是最有利于未成年子女。根据《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条第三款规定，离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。3个月的宝宝尚处于哺乳期，从婴儿的生长发育的利益考虑，此时由母亲抚养更有利于其健康成长。
母亲在生理和心理上通常更适合照顾年幼的宝宝。母乳喂养对婴儿的营养和健康至关重要，母亲在这个阶段能够给予宝宝更贴心、更合适的照料。而且，母亲在孕期和产后与宝宝建立起的亲密情感联系，也有助于宝宝的情感和心理发展。
不过，这并不意味着在所有情况下都绝对会判给母亲。如果母亲存在一些不利于抚养子女的情形，法院也可能会将抚养权判给父亲。比如母亲患有久治不愈的传染性疾病或者其他严重疾病，子女不宜与其共同生活；母亲有抚养条件不尽抚养义务，而父亲要求子女随其生活；因其他原因，子女确不宜随母亲生活的情况。
如果父母双方协议不满两周岁子女由父亲直接抚养，并对子女健康成长无不利影响的，人民法院也会予以支持。总之，法院在判决子女抚养权时，会综合考虑各种因素，以保障子女的合法权益和健康成长为出发点，做出最符合子女利益的判决。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》 第一千零八十四条
父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。
离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。
离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。
