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公司注销时，其账户余额一般先用于支付清算费用、职工工资、社会保险费用和法定补偿金，缴纳所欠税款，清偿公司债务，若还有剩余财产，则有限责任公司按照股东的出资比例分配，股份有限公司按照股东持有的股份比例分配。
公司注销是一个涉及多方面法律和财务问题的过程，对于公司账户余额的处理有着明确的规定和流程。
公司进入注销程序后，需要成立清算组。清算组的职责之一就是对公司的资产、负债进行全面清查，其中就包括对公司账户余额的梳理。在处理余额之前，要先支付一系列必要的费用。清算费用是首要支出，这涵盖了清算过程中产生的各种费用，如清算人员的报酬、办公费用等。接着，要保障职工的权益，支付职工工资、社会保险费用和法定补偿金。这体现了法律对劳动者权益的保护，确保职工在公司注销过程中不会受到损失。
之后，公司需要用账户余额缴纳所欠税款。依法纳税是公司的基本义务，即使在注销阶段也不能逃避。缴纳完税款后，再对公司的债务进行清偿。公司在经营过程中可能会有各种债务，如银行贷款、供应商货款等，需要按照法定顺序和比例进行偿还。
当完成上述所有支付和清偿后，如果公司账户还有剩余财产，对于有限责任公司而言，会按照股东的出资比例进行分配。这是因为有限责任公司的股东以其出资额为限对公司承担责任，所以在分配剩余财产时也依据出资比例。而对于股份有限公司，则按照股东持有的股份比例分配，股份的多少代表了股东在公司中的权益份额。
总之，公司注销时余额的处理需要严格按照法律规定的顺序和方式进行，以保障各方的合法权益，确保注销程序的合法、合规进行。
法律依据：
《中华人民共和国公司法》 第一百八十六条
清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，应当制定清算方案，并报股东会、股东大会或者人民法院确认。
公司财产在分别支付清算费用、职工的工资、社会保险费用和法定补偿金，缴纳所欠税款，清偿公司债务后的剩余财产，有限责任公司按照股东的出资比例分配，股份有限公司按照股东持有的股份比例分配。
清算期间，公司存续，但不得开展与清算无关的经营活动。公司财产在未依照前款规定清偿前，不得分配给股东。
