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变更公司股东流程通常包括内部决策、签署协议、申请登记、审核与领取新执照等步骤。
公司内部需作出决策。有限责任公司变更股东，需召开股东会并形成有效决议。根据《公司法》规定，股东会会议作出修改公司章程、增加或者减少注册资本的决议，以及公司合并、分立、解散或者变更公司形式的决议，必须经代表三分之二以上表决权的股东通过；而对于股东变更事宜，一般按照公司章程规定的表决方式进行，通常需经半数以上有表决权的股东同意。这一步骤是确保公司内部对于股东变更达成共识，保障公司运营的稳定性和决策的合法性。
要签署相关协议。出让方与受让方需签订《股权转让协议》，明确双方的权利和义务，包括转让的股权份额、转让价格、支付方式、违约责任等重要条款。同时，公司需修改公司章程中有关股东及其出资额的记载，这一修改同样需经过法定程序，如股东会表决通过。协议的签订和章程的修改是明确股东变更具体内容和公司治理结构调整的重要依据。
然后，准备申请材料并提交登记。需准备的材料包括公司法定代表人签署的《公司变更登记申请书》、新股东的主体资格证明或者自然人身份证件复印件、修改后的公司章程或者公司章程修正案、《股权转让协议》等。将这些材料提交至当地工商行政管理部门，申请办理股东变更登记。
接着，工商部门会对提交的材料进行审核。审核内容主要包括材料的完整性、真实性和合法性。若材料存在问题，工商部门会要求申请人补充或修改。
最后，审核通过后，申请人可以领取新的营业执照。至此，公司股东变更流程完成。整个过程中，还需注意税务方面的处理，如股权转让可能涉及个人所得税或企业所得税的缴纳，需按照相关税收法规进行申报和缴纳。
法律依据：
《中华人民共和国公司法》 第七十一条
有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。
股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。股东应就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意，其他股东自接到书面通知之日起满三十日未答复的，视为同意转让。其他股东半数以上不同意转让的，不同意的股东应当购买该转让的股权；不购买的，视为同意转让。
经股东同意转让的股权，在同等条件下，其他股东有优先购买权。两个以上股东主张行使优先购买权的，协商确定各自的购买比例；协商不成的，按照转让时各自的出资比例行使优先购买权。
公司章程对股权转让另有规定的，从其规定。
