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借款超过诉讼时效，若被告以诉讼时效抗辩，法院会判决驳回原告的诉讼请求；若被告未提出诉讼时效抗辩，法院不会主动适用诉讼时效规定进行裁判，可能会根据案件具体情况支持原告的诉讼请求。
诉讼时效是指民事权利受到侵害的权利人在法定的时效期间内不行使权利，当时效期间届满时，债务人获得诉讼时效抗辩权。在借款纠纷中，一般的诉讼时效为三年。
当借款超过诉讼时效后，如果被告在诉讼中以诉讼时效已过为由进行抗辩，根据法律规定，法院经审查认为诉讼时效确实已经届满，会判决驳回原告的诉讼请求。这意味着原告虽然享有债权，但由于其未在法定的诉讼时效期间内主张权利，丧失了通过司法强制力要求被告履行还款义务的胜诉权。例如，甲在2018年借给乙一笔钱，约定还款期限为一年，到2023年甲才向法院起诉要求乙还款，乙在诉讼中提出诉讼时效抗辩，法院查证属实后，就会判决驳回甲的诉讼请求。
然而，如果被告未提出诉讼时效抗辩，法院是不能主动适用诉讼时效的规定进行裁判的。因为诉讼时效抗辩权是被告的一项权利，被告有权选择是否行使。在这种情况下，法院会根据案件的其他证据和事实情况进行审理。如果原告能够提供充分的证据证明借款事实的存在以及借款金额等，法院可能会支持原告的诉讼请求，判决被告偿还借款。比如上述案例中，乙没有提出诉讼时效抗辩，甲又有借条、转账记录等充分证据，法院就可能判决乙偿还借款。
此外，即使借款超过诉讼时效，若被告自愿履行还款义务，之后又以诉讼时效期间届满为由反悔的，人民法院不予支持。因为诉讼时效届满后，债权本身并不消灭，只是丧失了胜诉权，债务人自愿履行的，不受诉讼时效限制。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》 第一百九十二条
诉讼时效期间届满的，义务人可以提出不履行义务的抗辩。
诉讼时效期间届满后，义务人同意履行的，不得以诉讼时效期间届满为由抗辩；义务人已经自愿履行的，不得请求返还。
《中华人民共和国民法典》 第一百八十八条
向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
