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商品房合同丢失仍可办理房产证，需先确定合同丢失的阶段，然后根据不同情况采取相应的补救措施，补全所需资料后按正常流程办理房产证。
要明确合同丢失所处的阶段。如果是在购房合同未做预售登记前丢失，相对处理较为简单。只需将剩余的合同作废，和开发商重新签订一份合同即可。因为此时合同尚未进行预售登记，开发商处还有相关合同备份，操作起来不会太复杂。
若购房合同已做完预售登记，但还未办理银行按揭，这时候合同丢失，需要在报纸上刊登声明合同作废，到三个月期满后，拿着报纸去做预售登记的机关申请注销所签订的那份合同，然后和开发商重新签订一份合同，再去做预售登记。这一系列操作是为了保证合同的唯一性和合法性，避免出现合同纠纷。
要是购房合同做完预售登记，且已经办理银行按揭后合同丢失，除了要办理上述第二种情况所涉及的手续外，还需要和办理贷款的银行签订一份变更协议，并将新的合同放在银行质押。因为银行在贷款时是以原合同为依据的，合同变更后需要重新确定双方的权利和义务。
在完成上述合同补救措施后，办理房产证还需要其他资料。一般包括房屋实测面积报告、契税完税凭证、购房发票、身份证明等。将这些资料准备齐全后，就可以前往当地的不动产登记中心办理房产证。在办理过程中，要按照登记中心的要求填写相关表格，提交资料，经过审核等环节，最终领取到房产证。总之，即使商品房合同丢失，只要按照正确的步骤处理，依然能够顺利办理房产证。
法律依据：
《商品房销售管理办法》 第十六条
商品房销售时，房地产开发企业和买受人应当订立书面商品房买卖合同。
《不动产登记暂行条例》 第二十七条
权利人、利害关系人可以依法查询、复制不动产登记资料，不动产登记机构应当提供。有关国家机关可以依照法律、行政法规的规定查询、复制与调查处理事项有关的不动产登记资料。
