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企业要抵扣增值税进项税额，需确保取得合法有效的扣税凭证，如增值税专用发票等；业务要符合规定，用于可抵扣项目；在规定时间内进行认证或勾选确认；按规定的计算方法计算可抵扣税额。
取得合法有效的扣税凭证：这是抵扣进项税的基础。常见的合法扣税凭证包括增值税专用发票，它是最主要的抵扣凭证，一般纳税人销售货物、劳务、服务等开具给购买方，购买方凭此抵扣；海关进口增值税专用缴款书，企业进口货物时，从海关取得的，上面注明的增值税额可用于抵扣；农产品收购发票或者销售发票，购进农产品时，按照规定的扣除率计算抵扣进项税额；解缴税款的完税凭证，从境外单位或者个人购进服务、无形资产或者不动产，自税务机关或者扣缴义务人取得的解缴税款的完税凭证上注明的增值税额准予抵扣。
业务符合规定：企业的进项业务必须用于可抵扣项目。用于简易计税方法计税项目、免征增值税项目、集体福利或者个人消费的购进货物、劳务、服务、无形资产和不动产，其进项税额不得从销项税额中抵扣。例如企业为员工提供的集体福利性质的餐饮服务，对应的进项税就不能抵扣。
认证或勾选确认：取得增值税专用发票等扣税凭证后，需要在规定时间内进行认证或勾选确认。目前，一般纳税人取得增值税专用发票等扣税凭证，可通过增值税发票综合服务平台进行勾选确认用途，没有了认证确认、稽核比对、申报抵扣的期限限制。
计算可抵扣税额：不同的扣税凭证计算方法不同。对于增值税专用发票和海关进口增值税专用缴款书，直接按照上面注明的税额抵扣。购进农产品，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和9%的扣除率计算进项税额；如果用于生产或者委托加工13%税率货物的农产品，按照10%的扣除率计算进项税额。
企业在抵扣进项税时，要严格按照相关规定操作，确保抵扣的合法性和准确性，避免税务风险。
法律依据：
《中华人民共和国增值税暂行条例》 第八条
纳税人购进货物、劳务、服务、无形资产、不动产支付或者负担的增值税额，为进项税额。
下列进项税额准予从销项税额中抵扣：
（一）从销售方取得的增值税专用发票上注明的增值税额。
（二）从海关取得的海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额。
（三）购进农产品，除取得增值税专用发票或者海关进口增值税专用缴款书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和11%的扣除率计算的进项税额，国务院另有规定的除外。进项税额计算公式：
进项税额＝买价×扣除率
（四）自境外单位或者个人购进劳务、服务、无形资产或者境内的不动产，从税务机关或者扣缴义务人取得的代扣代缴税款的完税凭证上注明的增值税额。
