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工程中标后通常需要缴纳履约保证金、农民工工资保证金、质量保证金等费用，还需按规定缴纳相关税费。
履约保证金是中标人必须要考虑的一项重要费用。它是为了保证中标人能够按照合同约定全面履行自己的义务。一般来说，履约保证金的金额会在招标文件中明确规定，通常为中标合同金额的一定比例，常见范围在5%-10%。这笔保证金可以采用现金、银行保函、担保公司担保等多种形式提交。在工程顺利完工并通过验收后，招标人会将履约保证金退还中标人。
农民工工资保证金也是中标后需要缴纳的费用。其目的是确保农民工的工资能够按时足额发放，避免出现拖欠农民工工资的情况。缴纳比例各地有所不同，一般为工程合同价款的1%-3%。这笔保证金会存入指定的专用账户，在工程建设过程中，如果没有发生拖欠农民工工资的问题，工程完工后会予以退还。
质量保证金同样不容忽视。它是为了保证工程质量，在缺陷责任期内对工程出现的质量问题进行维修。质量保证金一般从工程款中按一定比例预留，比例通常不高于工程价款结算总额的3%。在缺陷责任期满后，如工程未出现质量问题或已对质量问题进行了妥善处理，发包人会将质量保证金返还给承包人。
除了上述保证金外，中标人还需要缴纳相关税费。增值税是在工程建设过程中产生的流转税，一般纳税人执行一般计税方法的，适用税率为9%；小规模纳税人适用简易计税方法，征收率为3%。企业所得税则是对企业的生产经营所得和其他所得征收的一种税，税率一般为25%。此外，还可能涉及城市维护建设税、教育费附加等附加税费，这些税费通常是以增值税为计税依据，根据不同地区的规定按一定比例征收。
法律依据：
《中华人民共和国招标投标法》 第四十五条
中标人确定后，招标人应当向中标人发出中标通知书，并同时将中标结果通知所有未中标的投标人。中标通知书对招标人和中标人具有法律效力。中标通知书发出后，招标人改变中标结果的，或者中标人放弃中标项目的，应当依法承担法律责任。
《中华人民共和国招标投标法》 第四十六条
招标人和中标人应当自中标通知书发出之日起三十日内，按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同。招标人和中标人不得再行订立背离合同实质性内容的其他协议。招标文件要求中标人提交履约保证金的，中标人应当提交。
