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没结婚证意味着不存在法律意义上的婚姻关系，无需办理离婚手续。对于两个孩子的抚养权归属，双方可协商确定；协商不成的，可向法院起诉，法院会根据子女的权益和双方的具体情况判决。
在法律层面，只有办理了结婚登记手续，领取结婚证，才形成合法的婚姻关系。如果没有结婚证，那么双方只是同居关系，并不存在法律意义上的婚姻，也就不存在“离婚”这一说法。
关于两个孩子的抚养权问题，首先双方可以进行协商。在协商过程中，要充分考虑孩子的意愿（如果孩子已经具备一定的表达能力）、双方的经济状况、生活环境等因素，以确定孩子由哪一方直接抚养，另一方支付相应的抚养费。抚养费的数额通常根据子女的实际需要、父母双方的负担能力和当地的实际生活水平确定。
倘若双方无法就孩子抚养权达成一致意见，可以向人民法院提起诉讼。法院在审理抚养权纠纷案件时，会从有利于子女身心健康，保障子女的合法权益出发，结合父母双方的抚养能力和抚养条件等具体情况妥善解决。
对于两周岁以下的子女，一般会判给母亲抚养，除非母亲存在患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活等法定情形。对于两周岁以上未成年的子女，父方和母方均要求随其生活，一方有已做绝育手术或因其他原因丧失生育能力、子女随其生活时间较长，改变生活环境对子女健康成长明显不利等情形的，可予优先考虑。而对于八周岁以上的未成年子女，法院在判决时会尊重其真实意愿。
在实际判决中，如果是两个孩子，法院可能会判决双方各自抚养一个孩子，但这也不是绝对的，还是要根据具体情况进行综合判断。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》 第一千零八十四条
父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。
离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。
离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。
