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意外伤残鉴定可以在司法鉴定机构、劳动能力鉴定委员会等部门进行，不同情形下选择的鉴定部门有所不同。
在不同的意外情况中，伤残鉴定所涉及的鉴定部门存在差异。
如果是涉及民事侵权（如交通事故、故意伤害等）导致的意外伤残，一般要委托司法鉴定机构进行鉴定。司法鉴定机构是指在诉讼活动中接受委托人鉴定委托，遵循法律规定的方式、方法、步骤以及相关的规则和标准，对诉讼涉及的专门性问题运用科学技术或者专门知识进行鉴别和判断并提供鉴定意见的机构。在选择司法鉴定机构时，需要注意其是否具备相应的鉴定资质，可通过当地司法行政部门的官方网站查询鉴定机构的相关信息。这些机构出具的鉴定报告在民事诉讼中具有重要的证据作用，法院通常会依据其鉴定结果来确定赔偿责任和赔偿金额。
若是因工伤导致的意外伤残，则由劳动能力鉴定委员会负责鉴定。劳动能力鉴定委员会是由劳动保障行政部门、人事行政部门、卫生行政部门、工会组织、经办机构代表以及用人单位代表组成。职工发生工伤，经治疗伤情相对稳定后存在残疾、影响劳动能力的，应当进行劳动能力鉴定。劳动能力鉴定委员会作出的鉴定结论对于工伤职工享受工伤保险待遇至关重要，包括确定伤残等级、护理依赖程度等，进而决定职工能够获得的工伤赔偿项目和具体数额。
此外，在一些涉及保险理赔的意外伤残情况中，保险公司可能会指定符合其要求的鉴定机构进行鉴定。被保险人需要按照保险公司的规定和指引，在指定的鉴定机构完成伤残鉴定，以便顺利获得保险赔偿。
法律依据：
《司法鉴定程序通则》 第二十八条
司法鉴定机构应当自司法鉴定委托书生效之日起30个工作日内完成鉴定。
鉴定事项涉及复杂、疑难、特殊技术问题或者鉴定过程需要较长时间的，经本机构负责人批准，完成鉴定的时限可以延长，延长时限一般不得超过30个工作日。鉴定时限延长的，应当及时告知委托人。
司法鉴定机构与委托人对鉴定时限另有约定的，从其约定。
在鉴定过程中补充或者重新提取鉴定材料所需的时间，不计入鉴定时限。
