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当劝退员工不愿意离职时，不能强行办理离职手续，需依据具体情况，通过合法合规且合理的方式来处理，可考虑协商沟通、依据规章制度处理、支付经济补偿解除合同等途径。
要再次与员工进行坦诚的沟通。了解员工不愿意离职的原因，有可能是对补偿方案不满意，或者对未来职业发展感到担忧等。如果是补偿方面的问题，可以重新审视补偿标准，在合理合法的范围内进行适当调整，争取与员工达成一致。例如，按照法律规定，员工在本单位工作每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付经济补偿，六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。可以向员工清晰解释这些补偿政策，让员工明白其合理性。
若员工存在违反公司规章制度的行为，并且公司的规章制度是合法制定且向员工公示过的，公司可以依据这些规章制度解除劳动合同。比如员工严重违反公司的考勤制度，多次无故旷工，公司可以按照规定解除与该员工的劳动关系。但在操作过程中，要注意保留好相关证据，如考勤记录、违纪通知等，以避免后续可能出现的劳动纠纷。
如果没有合理的理由证明员工存在过错，公司可以选择提前三十日以书面形式通知员工本人或者额外支付员工一个月工资后，解除劳动合同。这种方式虽然需要公司付出一定的成本，但可以确保解除劳动合同的程序合法。
在整个过程中，要注意遵守劳动法律法规，避免违法解除劳动合同。如果违法解除，员工有权要求继续履行劳动合同，或者要求公司支付赔偿金，赔偿金是经济补偿标准的二倍。同时，要做好相关的沟通和解释工作，尽量减少对员工的负面影响，维护公司的良好形象。
法律依据：
《中华人民共和国劳动合同法》 第三十九条
劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：
（一）在试用期间被证明不符合录用条件的；
（二）严重违反用人单位的规章制度的；
（三）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；
（四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；
（五）因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；
（六）被依法追究刑事责任的。
