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股权转让时公司债务处理需区分不同情况，一般公司债务由公司以其自身财产承担，与股东变更无关，但要注意在股权转让协议中明确债务分担问题，避免后续纠纷。
首先要明确，公司作为独立的法人主体，具有独立的财产权，公司债务通常由公司以其全部财产对公司的债务承担责任。根据《中华人民共和国公司法》第三条规定，公司是企业法人，有独立的法人财产，享有法人财产权。公司以其全部财产对公司的债务承担责任。有限责任公司的股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任；股份有限公司的股东以其认购的股份为限对公司承担责任。这意味着，股东的变更，即股权转让本身并不影响公司对外承担债务的责任主体。
在股权转让过程中，为了保障各方的利益，需要对公司债务进行妥善处理。在签订股权转让协议前，出让方和受让方应对公司的债务情况进行全面的调查和了解。出让方有义务如实披露公司的债务状况，包括已存在的债务、潜在的债务等。如果出让方故意隐瞒债务，受让方在发现后有权依据股权转让协议追究出让方的违约责任。
对于债务的分担，双方可以在股权转让协议中进行明确约定。一种常见的方式是约定在股权转让基准日之前的债务由出让方承担，基准日之后的债务由受让方承担。但这种约定仅在出让方和受让方之间具有法律效力，不能对抗公司的债权人。也就是说，如果公司债权人要求公司承担债务，公司不能以股权转让协议中关于债务分担的约定为由拒绝承担。
在股权转让后，公司应及时办理相关的工商变更登记手续，以确保公司的股东信息准确无误。同时，公司也应按照规定的程序和要求，对债务进行妥善管理和处理，保障公司的正常运营和债权人的合法权益。股权转让时公司债务的处理需要遵循法律法规的规定，通过合理的协议约定和规范的操作流程，来保障各方的合法权益，避免潜在的法律风险。
法律依据：
《中华人民共和国公司法》 第三条
公司是企业法人，有独立的法人财产，享有法人财产权。公司以其全部财产对公司的债务承担责任。
有限责任公司的股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任；股份有限公司的股东以其认购的股份为限对公司承担责任。
《中华人民共和国公司法》 第四条
公司股东依法享有资产收益、参与重大决策和选择管理者等权利。
