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公司股东变更手续办理通常需先进行内部决策，然后准备相关材料，接着向工商行政管理部门提交申请，审核通过后领取新的营业执照，最后进行税务变更登记等后续操作。
第一步：内部决策与协商。在股东变更前，公司需召开股东会，由股东会对股东变更事宜进行表决。这是因为股东变更涉及公司的股权结构变化，会对公司的治理和运营产生影响，所以需要全体股东根据公司章程规定的议事规则和表决程序进行决策。同时，出让方与受让方要就股权转让事宜进行充分协商，明确转让价格、支付方式、转让比例等关键条款，并签订股权转让协议。该协议是双方权利义务的重要依据，应确保内容合法、明确、完整。
第二步：准备申请材料。一般需要准备以下材料：公司章程修正案，需明确记载股东变更的相关内容；股东会决议，体现股东对变更事项的表决结果；股权转让协议；新股东的主体资格证明或自然人身份证明；公司营业执照正副本等。不同地区可能会有细微差异，可提前咨询当地工商行政管理部门。
第三步：工商变更登记。将准备好的申请材料提交至公司登记机关，通常是当地的工商行政管理部门。登记机关会对提交的材料进行审核，主要审查材料的完整性、合法性以及是否符合法定形式。如果材料存在问题，登记机关会要求申请人补充或修改。审核通过后，公司即可领取新的营业执照，上面会显示变更后的股东信息。
第四步：税务变更登记。股东变更可能会涉及到税务方面的调整，因此需要到税务部门办理税务变更登记。税务部门会对股权转让是否涉及纳税情况进行核查，如是否需要缴纳印花税、个人所得税等。纳税人应按照规定及时、足额缴纳相关税款。
第五步：其他事项。公司还需修改股东名册，将新股东的姓名或名称、住所、出资额等信息记载于股东名册，以确认新股东的身份和权益。同时，根据需要可以到银行等相关部门办理账户信息变更等手续，确保公司运营的各项事务顺利衔接。
法律依据：
《中华人民共和国公司法》 第三十四条
股东按照实缴的出资比例分取红利；公司新增资本时，股东有权优先按照实缴的出资比例认缴出资。但是，全体股东约定不按照出资比例分取红利或者不按照出资比例优先认缴出资的除外。
《中华人民共和国公司法》 第四条
公司股东依法享有资产收益、参与重大决策和选择管理者等权利。
