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分居两年离婚手续的办理方式有两种，即协议离婚和诉讼离婚。协议离婚需双方就离婚事宜达成一致，共同到婚姻登记机关申请离婚登记；诉讼离婚则是一方向法院提起离婚诉讼，由法院审理判决。
首先来了解协议离婚的办理流程。协议离婚要求夫妻双方自愿离婚，并就子女抚养、财产分割、债务处理等事项协商一致，签订书面离婚协议。根据《中华人民共和国民法典》规定，夫妻双方要亲自到一方户口所在地的婚姻登记机关申请离婚登记。婚姻登记机关收到离婚登记申请并向当事人发放《离婚登记申请受理回执单》后，进入为期三十日的冷静期。在冷静期内，任何一方反悔都可以持本人有效身份证件和《离婚登记申请受理回执单》，向受理离婚登记申请的婚姻登记机关撤回离婚登记申请，并亲自填写《撤回离婚登记申请书》。经婚姻登记机关核实无误后，发给《撤回离婚登记确认单》，并将离婚协议书等相关材料存档。自离婚冷静期届满后三十日内，双方未共同到婚姻登记机关申请发给离婚证的，视为撤回离婚登记申请。冷静期届满后三十日内，双方需再次共同到婚姻登记机关申请发给离婚证，经审查符合条件的，予以登记，发给离婚证。
而诉讼离婚，一般是在一方不同意离婚或者双方就离婚相关事宜无法达成一致的情况下选择。想要离婚的一方需要向有管辖权的法院提起离婚诉讼，通常是向被告住所地法院起诉，如果被告住所地与经常居住地不一致的，向经常居住地法院起诉。起诉时要提交起诉状、结婚证、身份证、相关证据等材料。这里的证据可以包括能证明分居两年的证据，比如分居协议、租房合同、居委会证明等。法院受理案件后会进行审理，审理过程包括调解和判决。如果法院认定夫妻感情确已破裂，调解无效的，会判决准予离婚。需要注意的是，分居两年并不必然导致法院判决离婚，只是判断夫妻感情是否破裂的一个参考因素。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》 第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
