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店铺产权40年到期指的是土地使用权到期，一般可自动续期，需按照法律规定缴纳土地出让金。
要明确店铺40年产权的性质。通常所说的店铺40年产权，是指该店铺所占用土地的使用权年限为40年，土地性质多为商业用地。而店铺本身作为地上建筑物，其所有权是永久属于业主的。
当土地使用年限到期后，根据《中华人民共和国民法典》第三百五十九条第二款规定，非住宅建设用地使用权期限届满后的续期，依照法律规定办理。该土地上的房屋以及其他不动产的归属，有约定的，按照约定；没有约定或者约定不明确的，依照法律、行政法规的规定办理。
目前对于商业用地土地使用权到期后续期的具体操作细则，还需依据各地的相关规定执行。一般情况下是可以续期的，但需要缴纳一定的土地出让金。土地出让金的计算方式和缴纳标准因地区而异，会受到当地的土地市场价格、土地用途、地块位置等多种因素的影响。
在实际操作中，土地使用者需要在土地使用权到期前，向当地的土地管理部门提出续期申请。管理部门会根据具体情况进行审核，如果该地块没有其他规划用途等特殊情况，通常会批准续期申请。
若土地使用者未提出续期申请，或者申请未获批准，土地使用权将由国家无偿收回，地上建筑物的处理则需按照相关法律法规和合同约定执行。不过，从保障公民财产权益和城市商业发展的角度来看，只要符合规划和相关要求，一般会允许土地使用者续期。
法律依据：
《中华人民共和国城镇国有土地使用权出让和转让暂行条例》 第十二条
土地使用权出让最高年限按下列用途确定：
1、居住用地70年；
2、工业用地50年；
3、教育、科技、文化、卫生、体育用地年限为50年；
4、商业、旅游、娱乐用地40年；
5、仓储用地50年；
6、综合或者其他用地50年。
《中华人民共和国城市房地产管理法》 第二十一条
土地使用权出让合同约定的年限届满，土地使用者需要继续使用的，应当至迟于届满前一年申请续期，除根据社会公共利益需要收回该幅土地的，应当予以批准。续期的，应重新签订土地使用权出让合同，依照规定支付土地使用权出让金。
