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离职工资天数是否扣掉周末需根据具体情况确定，一般按照劳动合同约定及公司规章制度来执行。若实行标准工时制且周末双休是正常休息，计算工资时通常不包含周末；若周末加班且符合支付加班费条件，则应计算相应报酬。
在劳动法律关系中，工资计算与工作制度密切相关。标准工时制，根据《国务院关于职工工作时间的规定》，我国实行劳动者每日工作时间不超过8小时、平均每周工作时间不超过40小时的工时制度，通常为周一至周五工作，周六和周日为休息日。在这种情况下，离职工资计算一般以实际工作天数为准，不包含周末。例如，员工在月中离职，工作了15个工作日，其工资就按照这15天来计算。计算公式为：月工资收入÷月计薪天数×实际工作天数。这里的月计薪天数为21.75天，它是（365天 - 104天）÷12个月得出的，104天为一年的休息日（即周末）。
如果存在周末加班的情况，就需要区别对待。根据《中华人民共和国劳动法》规定，用人单位依法安排劳动者在休息日工作，而又不能安排补休的，按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的200%支付劳动者工资。也就是说，若员工在离职前的周末有加班且公司未安排补休，那么这部分周末加班时间应计算加班费，并计入离职工资中。
还有综合计算工时制和不定时工时制。综合计算工时制是指分别以周、月、季、年等为周期，综合计算工作时间，但其平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。在这种工时制下，只要在综合计算周期内的总实际工作时间不超过总法定标准工作时间，周末可能不算额外工作时间；若超过，则超过部分应按照加班来支付工资。不定时工时制则是因工作性质、特点或工作职责的限制，无法按标准工作时间衡量或是需要机动作业的职工所采用的，劳动者每一工作日没有固定的上下班时间限制。对于实行不定时工作制的员工，一般不存在周末加班工资的问题，但具体也需依据各地规定和劳动合同约定。
离职工资天数是否扣掉周末要依据不同的工时制度、加班情况以及劳动合同和公司规定来准确计算，以保障劳动者的合法权益。
法律依据：
《中华人民共和国劳动法》 第三十六条
国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。
第三十八条
用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。
第三十九条
企业因生产特点不能实行本法第三十六条、第三十八条规定的，经劳动行政部门批准，可以实行其他工作和休息办法。
