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个人独资企业税务申报流程包括税务登记、确定申报税种及期限、准备申报资料、选择申报方式进行申报、缴纳税款等步骤。
税务登记。个人独资企业在领取营业执照后的一定时间内（通常是30日内），需携带营业执照、法定代表人身份证明等相关资料到当地税务机关办理税务登记。税务机关会根据企业的经营范围等信息，核定企业需要缴纳的税种和适用的税率等。
接着要确定申报税种及期限。个人独资企业涉及的主要税种有增值税、个人所得税（经营所得）、附加税等。增值税一般根据企业是小规模纳税人还是一般纳税人来确定申报期限，小规模纳税人通常按季度申报，一般纳税人按月申报。个人所得税（经营所得）按年计算，分月或者分季预缴，由投资者在每月或者每季度终了后15日内预缴，年度终了后3个月内汇算清缴。附加税一般跟随增值税的申报期限。
然后准备申报资料。不同的税种所需的申报资料有所不同。以增值税为例，小规模纳税人可能需要准备《增值税纳税申报表（小规模纳税人适用）》，一般纳税人则需要准备《增值税纳税申报表（一般纳税人适用）》及附列资料等。对于个人所得税（经营所得），需填写《个人所得税经营所得纳税申报表（A表）》（预缴时）或《个人所得税经营所得纳税申报表（B表）》（汇算清缴时）。
之后选择申报方式进行申报。常见的申报方式有网上申报和上门申报。网上申报较为便捷，企业可以登录当地税务机关的电子税务局网站，按照系统提示填写申报表格，上传相关资料，提交申报。上门申报则需要企业办税人员携带申报资料到当地税务机关的办税服务厅，在窗口进行申报。
最后缴纳税款。申报成功后，企业需要按照税务机关规定的方式缴纳税款。可以通过网上银行转账、办税服务厅POS机刷卡等方式完成税款缴纳。如果企业在申报过程中遇到问题或有疑问，可以随时咨询当地税务机关的工作人员。
法律依据：
《中华人民共和国税收征收管理法》 第二十五条
纳税人必须依照法律、行政法规规定或者税务机关依照法律、行政法规的规定确定的申报期限、申报内容如实办理纳税申报，报送纳税申报表、财务会计报表以及税务机关根据实际需要要求纳税人报送的其他纳税资料。
扣缴义务人必须依照法律、行政法规规定或者税务机关依照法律、行政法规的规定确定的申报期限、申报内容如实报送代扣代缴、代收代缴税款报告表以及税务机关根据实际需要要求扣缴义务人报送的其他有关资料。
