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个人名义参保和公司名义参保在参保险种、缴费基数、缴费比例、退休年龄和待遇、医保报销等方面存在区别。
参保险种不同。以公司名义参保，通常包含养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险这五险，保障较为全面。而以个人名义参保，一般只能参加养老保险和医疗保险，部分地区允许以灵活就业人员身份单独参加职工医保，相比之下保障范围较窄。
缴费基数不同。公司参保时，缴费基数通常是根据员工上一年度的月平均工资来确定，工资越高，缴费基数越高。个人参保时，缴费基数则是由个人在当地社保部门规定的若干个档次中自行选择，一般分为不同的缴费档次，最低档可能是当地上年度社会平均工资的一定比例，最高档也有相应上限。
缴费比例不同。公司参保时，社保费用由公司和个人共同承担。例如养老保险，企业缴纳比例一般在16%左右，个人缴纳8%；医疗保险企业缴纳比例约为8%-10%，个人缴纳2%左右。而个人参保时，所有费用都由个人承担，缴费比例相对较高。以灵活就业人员身份参加职工养老保险，缴费比例通常为20%。
退休年龄和待遇不同。在退休年龄方面，女性职工退休年龄一般为50-55岁，而以个人名义参保的女性灵活就业人员，退休年龄可能为55岁。在养老金待遇方面，虽然两者的养老金计算方式基本相同，但由于缴费基数、缴费年限等因素的差异，最终领取的养老金数额可能有所不同。
医保报销不同。公司参保的职工医保报销比例和报销上限一般相对较高，且有个人账户，可以用于支付门诊费用和药店购药。个人参保的灵活就业人员医保，部分地区可能没有个人账户，或者个人账户金额较少，报销比例和报销上限也可能略低于公司参保的职工医保。
法律依据：
《中华人民共和国社会保险法》 第二条
国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度，保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。
