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工伤认定超时后，仍可通过其他途径报销医药费用，如与用人单位协商由其承担费用、通过民事诉讼要求用人单位赔偿、利用医保报销等。
与用人单位协商：工伤认定超时，若用人单位存在过错，比如未在规定时间内为职工申请工伤认定，职工可与用人单位进行协商。根据《工伤保险条例》规定，用人单位未在规定的时限内提交工伤认定申请，在此期间发生符合本条例规定的工伤待遇等有关费用由该用人单位负担。所以职工可要求用人单位承担医药费用，双方可就费用支付方式、金额等进行协商，争取达成一致解决方案。
民事诉讼途径：若与用人单位协商无果，职工可以通过民事诉讼来维护自身权益。职工需要收集相关证据，如劳动合同、医疗记录、事故现场证人证言等，证明自己是在工作过程中受伤。向法院提起诉讼，要求用人单位承担赔偿责任。法院会根据双方提供的证据和具体情况进行审理和判决。
医保报销：在工伤认定超时且无法通过其他途径解决费用问题时，职工可以考虑使用医保报销医药费用。根据社会保险法规定，符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。不过需要注意的是，若已经通过医保报销了部分费用，在后续如果认定为工伤，可能需要对医保报销和工伤报销进行相应的调整。
此外，不同地区的具体政策和操作流程可能存在差异，职工在处理工伤认定超时后的医药费用报销问题时，可向当地的社保部门或专业律师咨询，以获取更准确和详细的指导。
法律依据：
《中华人民共和国社会保险法》 第二条
国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度，保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。
《中华人民共和国社会保险法》 第四条
中华人民共和国境内的用人单位和个人依法缴纳社会保险费，有权查询缴费记录、个人权益记录，要求社会保险经办机构提供社会保险咨询等相关服务。
个人依法享受社会保险待遇，有权监督本单位为其缴费情况。
