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两份合同不一样以哪份为主需要根据具体情况判断。一般后签订的合同可视为对前合同的变更，以在后签订的合同为主；若合同明确约定了效力优先顺序，则依约定；若存在主从合同关系，通常以主合同为准。
在商业活动和日常生活中，有时会出现签订两份内容不同合同的情况。判断以哪份合同为主，首先要考虑合同签订的时间顺序。通常来说，按照合同变更的原理，后签订的合同往往是双方当事人在充分考虑原有合同的基础上，对相关权利义务进行了新的约定，可视为对前一份合同的修改和补充。所以，在没有其他特殊约定的情况下，后签订的合同具有优先效力。例如，甲乙双方先签订了一份房屋租赁合同，约定租金为每月 3000 元，之后双方又签订了一份新的合同，将租金调整为每月 3200 元，那么就应以第二份合同为准。
要看合同中是否有关于效力优先顺序的明确约定。合同是当事人意思自治的体现，如果双方在合同中明确写明哪份合同优先适用，那么就应当按照合同约定来确定以哪份合同为主。比如，合同中明确规定“本合同与之前签订的合同有冲突的，以本合同为准”，这种情况下就应遵循该约定。
另外，当存在主从合同关系时，一般以主合同为主。主合同是不依赖其他合同而独立存在的合同，从合同则是依附于主合同而存在的合同。从合同的效力通常受主合同的影响，并且在内容上也是围绕主合同来确定相关权利义务。比如，在贷款合同和担保合同中，贷款合同是主合同，担保合同是从合同，若两份合同内容有不一致，应以贷款合同为主。总之，确定两份不同合同哪份为主需综合多方面因素判断，必要时可寻求法律专业人士的帮助。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》 第一百四十三条
具备下列条件的民事法律行为有效：
（一）行为人具有相应的民事行为能力；
（二）意思表示真实；
（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
第一百四十四条
无民事行为能力人实施的民事法律行为无效。
