单位共同犯罪的处理需根据各单位在犯罪中所起的作用区分主从犯,一般对主犯按其参与或组织、指挥的全部犯罪处罚,对从犯从轻、减轻处罚或免除处罚,同时遵循单位犯罪双罚制或单罚制原则,对单位和直接负责的主管人员及其他直接责任人员进行处罚。
要明确单位共同犯罪的认定。单位共同犯罪是指两个以上单位共同故意实施的犯罪。在司法实践中,判断是否构成单位共同犯罪,需看各单位是否具有共同犯罪的故意以及是否实施了共同的犯罪行为。共同故意要求各单位对犯罪行为及其结果有共同的认识和意愿。
对于单位共同犯罪的处罚,关键在于区分主从犯。主犯是在单位共同犯罪中起主要作用的单位,通常是发起、策划犯罪,或者在犯罪实施过程中起主导作用的单位。从犯则是起次要或辅助作用的单位,比如为主要犯罪单位提供帮助、协助等。
对于主犯单位,按照《中华人民共和国刑法》规定,应按照其参与或者组织、指挥的全部犯罪处罚。这意味着主犯单位要对整个犯罪行为的后果承担主要责任。而对于从犯单位,应当根据其在犯罪中的具体作用,从轻、减轻处罚或者免除处罚。
在对单位共同犯罪进行处罚时,还需遵循单位犯罪的处罚原则,即双罚制和单罚制。双罚制是既处罚单位,又处罚直接负责的主管人员和其他直接责任人员。单位一般被判处罚金,而相关人员则根据具体犯罪情节判处相应刑罚。单罚制则只处罚直接负责的主管人员和其他直接责任人员,不处罚单位。
在司法实践中,法院会综合考虑各种因素,如单位的主观恶性、犯罪行为的危害后果、各单位在犯罪中的具体行为等,来准确认定主从犯,并合理确定处罚的幅度,以实现罪责刑相适应的原则。

法律依据:
《中华人民共和国刑法》 第二十五条
共同犯罪是指二人以上共同故意犯罪。
二人以上共同过失犯罪,不以共同犯罪论处;应当负刑事责任的,按照他们所犯的罪分别处罚。
《中华人民共和国刑法》 第三十条
公司、企业、事业单位、机关、团体实施的危害社会的行为,法律规定为单位犯罪的,应当负刑事责任。