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公司股权转让的印花税一般由转让方和受让方共同承担，双方需按照规定各自缴纳相应份额。
印花税的缴纳主体规定。根据我国印花税相关规定，在中华人民共和国境内书立应税凭证、进行证券交易的单位和个人，为印花税的纳税人。对于公司股权转让，所签订的股权转让合同属于印花税应税凭证中的产权转移书据。因此，股权转让行为中的转让方和受让方都属于印花税的纳税人，需要按照合同金额的一定比例缴纳印花税。
税率及计算方式。目前，股权转让印花税的税率为万分之五。其计算方式是以股权转让合同中所记载的金额为计税依据，乘以适用税率来确定应纳税额。例如，甲将其持有的公司股权以 100 万元的价格转让给乙，那么甲和乙都需要分别缴纳印花税 1000000×0.0005 = 500 元。
特殊情况及约定。虽然税法规定转让方和受让方都有缴纳印花税的义务，但在实际的股权转让交易中，交易双方可以通过合同约定来确定最终由哪一方承担印花税。不过这种约定只是在交易双方之间具有法律效力，并不影响税务机关对印花税纳税人的认定。如果合同约定由一方承担印花税，但该方未按照约定缴纳，税务机关仍然有权向法定的纳税人（即转让方和受让方）追缴税款。
缴纳时间和方式。一般来说，纳税人应当在书立应税凭证或者完成证券交易的当日起纳税义务即已产生。缴纳方式可以选择自行计算应纳税额，购买并一次贴足印花税票（贴花），也可以采用按期汇总缴纳等其他方式，具体按照当地税务机关的要求执行。总之，公司股权转让的印花税通常由转让方和受让方共同承担，但交易双方可通过约定进行调整。
法律依据：
《中华人民共和国印花税法》 第一条
在中华人民共和国境内书立应税凭证、进行证券交易的单位和个人，为印花税的纳税人，应当依照本法规定缴纳印花税。
在中华人民共和国境外书立在境内使用的应税凭证的单位和个人，应当依照本法规定缴纳印花税。
第四条
印花税的税目、税率，依照本法所附《印花税税目税率表》执行。
