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自然人的软件著作权保护期限为作者终生及其死亡后50年，截止于自然人死亡后第50年的12月31日。
软件著作权的保护期限由《计算机软件保护条例》明确规定，其中自然人作为软件开发者时，其权利保护期限的计算方式具有特殊性。根据《计算机软件保护条例》第十四条，自然人的软件著作权保护期从软件开发完成之日起开始计算，覆盖开发者的整个生命历程，并且在其死亡后继续延续50年，最终截止于死亡后第50年的12月31日。这一期限设定既保障了开发者生前对软件的专有权利，也为其继承人预留了合理的权利行使时间。
需要明确的是，“软件开发完成日”是保护期限计算的起点。实践中，开发完成日通常指软件达到稳定可用状态、主要功能实现且不再进行实质性修改的日期。若软件存在多个版本，每个版本的开发完成日独立计算，保护期限也分别起算。例如，某开发者2020年完成1.0版本软件，2025年完成2.0版本，则两个版本的保护期限分别从2020年和2025年开始计算。
对于合作开发的软件，若合作开发者均为自然人，保护期限以最后死亡的自然人死亡时间为基准，截止于该自然人死亡后第50年的12月31日。这种规定旨在平衡所有合作开发者及其继承人的利益，避免因部分开发者死亡导致权利提前终止。例如，A、B两人合作开发软件，A于2030年死亡，B于2040年死亡，则该软件的保护期限截止于2040年后第50年，即2090年12月31日。
针对身份不明的软件开发者，《计算机软件保护条例》规定，若软件著作权人身份无法确定，保护期限自软件首次发表之日起计算50年；若软件自开发完成之日起50年内未发表，则不再受著作权法保护。这一规则主要适用于匿名或假名发布的软件，旨在促使开发者及时明确身份以获得更长期限的保护。
软件著作权中的人身权利（如署名权、修改权等）具有永久性，不受保护期限限制，但财产权利（如复制权、发行权、信息网络传播权等）则严格遵循上述50年期限。当保护期限届满，软件的财产权利进入公有领域，任何组织或个人可自由使用该软件，无需获得许可或支付报酬，但仍需尊重开发者的署名权等人身权利。
此外，权利继承不影响保护期限的计算。自然人死亡后，软件著作权中的财产权利可依法继承，继承人在剩余保护期限内享有专有权利，但期限不会因继承而延长。例如，开发者于2023年死亡，其继承人继承软件著作权后，权利行使期限截止于2023年后第50年，即2073年12月31日。
综上，自然人软件著作权的保护期限是法律对软件智力成果的阶段性保护，既激励创新，也促进技术传播。开发者及相关权利人需关注期限节点，及时行使权利或做好权利交接安排，以最大化保护软件的商业价值。
法律依据：
《计算机软件保护条例》 第十四条
软件著作权自软件开发完成之日起产生。
自然人的软件著作权，保护期为自然人终生及其死亡后50年，截止于自然人死亡后第50年的12月31日；软件是合作开发的，截止于最后死亡的自然人死亡后第50年的12月31日。
法人或者其他组织的软件著作权，保护期为50年，截止于软件首次发表后第50年的12月31日，但软件自开发完成之日起50年内未发表的，本条例不再保护。
