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电子税务局注销公司需先完成相关准备工作，然后登录电子税务局，进入注销套餐模块，按系统提示依次完成各项涉税事项的处理，最后提交注销申请，等待税务机关审核。
一、准备工作
在进行电子税务局注销公司操作前，要确保公司已完成以下事项：结清应纳税款、多退（免）税款、滞纳金和罚款；缴销发票和税控设备；完成企业所得税清算申报；有分支机构的，需先完成分支机构注销等。
二、登录电子税务局
打开当地电子税务局官方网站，使用法定代表人、财务负责人或办税人员的账号密码登录，也可通过CA证书、电子营业执照等方式登录。
三、进入注销套餐模块
登录后，在电子税务局首页搜索栏输入“注销税务登记”或在相关菜单中找到“清税注销税（费）申报及缴纳套餐”，点击进入注销套餐页面。
四、数据初始化
进入注销套餐后，系统会自动对纳税人的基本信息、纳税申报、发票使用等情况进行初始化，检查是否存在未办结事项。如果存在未办结事项，系统会一一列出，纳税人需按照要求先完成这些事项。
五、完成各项涉税事项处理
1. 申报纳税：按照系统提示，完成当期及往期的各类税费申报，包括增值税、企业所得税、个人所得税、印花税等。
2. 发票缴销：如有未使用完的空白发票，需在电子税务局中进行发票缴销操作。
3. 税控设备注销：如果使用了税控设备，需先在开票系统中进行抄报税，然后在电子税务局申请注销税控设备。
六、提交注销申请
当所有未办结事项处理完毕后，在注销套餐页面点击“提交申请”，系统会生成《清税申报表》或《注销税务登记申请审批表》，纳税人确认信息无误后，点击“下一步”提交申请。
七、等待税务机关审核
税务机关会对纳税人提交的注销申请进行审核，审核过程中可能会要求纳税人提供相关资料进行核实。纳税人可在电子税务局的“办税进度及结果信息查询”模块中查看审核进度。如果审核通过，税务机关会出具《清税证明》，至此公司税务注销完成。
法律依据：
《中华人民共和国民事诉讼法》 第二百二十一条
债权人请求债务人给付金钱、有价证券，符合下列条件的，可以向有管辖权的基层人民法院申请支付令：
（一）债权人与债务人没有其他债务纠纷的；
（二）支付令能够送达债务人的。
申请书应当写明请求给付金钱或者有价证券的数量和所根据的事实、证据。
