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刑事案件审查起诉阶段流程主要包括案件受理、审查内容、补充侦查、作出决定等环节。
案件受理。公安机关侦查终结的案件，会将相关证据材料、法律文书等移送到人民检察院，人民检察院案件管理部门负责统一受理。案件管理部门会对移送的材料进行形式审查，查看材料是否齐全、是否符合规定等。如果材料不符合要求，会要求公安机关补充相关材料。
接着进入审查内容环节。承办案件的检察官会对案件进行全面审查。一方面要审查犯罪事实、情节是否清楚，证据是否确实、充分，犯罪性质和罪名的认定是否正确。比如要仔细核对证人证言、物证、书证等各类证据之间是否相互印证，有无矛盾之处。另一方面要审查有无遗漏罪行和其他应当追究刑事责任的人，以及是否属于不应当追究刑事责任的情况。同时，还要审查侦查活动是否合法，有无刑讯逼供、非法取证等违法行为。
在审查过程中，如果发现证据不足等情况，可能会进行补充侦查。补充侦查分为退回公安机关补充侦查和自行侦查两种方式。退回公安机关补充侦查的，公安机关应当在一个月以内补充侦查完毕，补充侦查以二次为限。自行侦查则由检察院自行开展相关调查工作。
作出决定。经过审查后，检察院会根据不同情况作出相应决定。如果犯罪事实清楚，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，会作出起诉决定，向人民法院提起公诉。如果犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，可以作出不起诉决定。对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。
法律依据：
《中华人民共和国刑事诉讼法》 第一百七十二条
人民检察院对于监察机关、公安机关移送起诉的案件，应当在一个月以内作出决定，重大、复杂的案件，可以延长十五日；犯罪嫌疑人认罪认罚，符合速裁程序适用条件的，应当在十日以内作出决定，对可能判处的有期徒刑超过一年的，可以延长至十五日。人民检察院审查起诉的案件，改变管辖的，从改变后的人民检察院收到案件之日起计算审查起诉期限。
