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医疗事故的赔偿费一般由医疗机构支付。
在医疗活动中，当发生医疗事故时，赔偿责任主体通常是医疗机构。这是因为医疗机构是医务人员进行医疗服务的载体，医务人员是在医疗机构的组织和管理下开展工作的。根据相关法律规定，患者在诊疗活动中受到损害，医疗机构及其医务人员有过错的，由医疗机构承担赔偿责任。
从法律关系角度来看，患者与医疗机构之间形成了医疗服务合同关系。当医疗机构及其医务人员在履行合同过程中因过错导致医疗事故，就构成了违约行为，医疗机构需要为此承担违约赔偿责任。同时，这种过错行为也可能侵犯了患者的人身权益，构成侵权责任。无论是基于违约还是侵权，赔偿责任都应由医疗机构来承担。
例如，某医院医生在手术过程中因操作失误导致患者出现严重并发症，经过医疗事故鉴定确定为医疗事故。在这种情况下，患者要求的赔偿费用将由该医院支付，而不是由实施手术的医生个人支付。不过，医疗机构在承担赔偿责任后，如果医务人员存在重大过失等情况，医疗机构可以依据内部规章制度向有过错的医务人员进行追偿。
如果是在存在多个医疗机构参与诊疗的复杂情况下，可能需要根据各医疗机构在医疗事故中的过错程度来确定各自应承担的赔偿份额。比如，患者先在A医院进行初步诊断和治疗，后转至B医院进行进一步手术，最终发生医疗事故。经过鉴定，A医院的诊断失误与B医院的手术操作不当都对事故的发生有一定影响，那么A医院和B医院将按照各自的过错比例分担赔偿费用。
一般情况下医疗事故赔偿费由医疗机构支付，但在具体案件中，需要根据实际情况确定赔偿责任的承担主体和方式。
法律依据：
《医疗事故处理条例》 第二条
本条例所称医疗事故，是指医疗机构及其医务人员在医疗活动中，违反医疗卫生管理法律、行政法规、部门规章和诊疗护理规范、常规，过失造成患者人身损害的事故。
《中华人民共和国民法典》 第一千二百一十八条
患者在诊疗活动中受到损害，医疗机构或者其医务人员有过错的，由医疗机构承担赔偿责任。
