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女方婚内出轨怀了别人孩子，双方可通过协议离婚或诉讼离婚两种方式办理离婚。
首先是协议离婚。协议离婚是一种相对平和、高效的离婚方式。双方需要就离婚相关事宜，如子女抚养、财产分割、债务分担等问题达成一致意见。在女方婚内出轨怀他人孩子这种情况下，虽然女方存在过错，但在协议过程中，双方仍需遵循平等、自愿、公平的原则。达成一致后，双方需签订书面离婚协议，该协议应明确载明双方自愿离婚的意思表示以及对子女抚养、财产和债务处理等事项协商一致的意见。然后，双方携带本人的户口簿、身份证、结婚证以及离婚协议书，共同到一方当事人常住户口所在地的婚姻登记机关办理离婚登记。自婚姻登记机关收到离婚登记申请并向当事人发放《离婚登记申请受理回执单》之日起三十日内，任何一方反悔都可以持本人有效身份证件和《离婚登记申请受理回执单》，向受理离婚登记申请的婚姻登记机关撤回离婚登记申请，并亲自填写《撤回离婚登记申请书》。经婚姻登记机关核实无误后，发给《撤回离婚登记确认单》，并将离婚登记申请书及相关材料归档。自离婚冷静期届满后三十日内，双方未共同到婚姻登记机关申请发给离婚证的，视为撤回离婚登记申请。冷静期届满后，双方需再次共同到婚姻登记机关申请发给离婚证，经审查符合条件的，予以登记，发给离婚证。
其次是诉讼离婚。如果双方无法就离婚相关事宜达成一致，那么可以选择诉讼离婚。男方作为原告，需要向有管辖权的人民法院提起离婚诉讼。在起诉时，要准备好起诉状，起诉状应包含原告和被告的基本信息、诉讼请求（如判决离婚、子女抚养权归属、财产分割等）、事实与理由（详细说明女方婚内出轨并怀有他人孩子的情况）等内容。同时，要收集相关证据，如女方出轨的证据、其怀孕的医院检查报告等，以支持自己的诉讼请求。法院在受理案件后，会先进行调解。调解是离婚诉讼的必经程序，法院会根据双方的实际情况，尝试促成双方达成和解或达成离婚协议。如果调解无效，法院将根据庭审情况和相关证据进行判决。在这种女方存在重大过错的情况下，法院在判决时会综合考虑各种因素，在财产分割、子女抚养等方面可能会倾向于无过错方。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》 第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
