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离婚后两个孩子的抚养权归属需综合多方面因素判定，可能一方抚养两个孩子，也可能双方各抚养一个，要以最有利于孩子成长为原则。
在司法实践中，离婚时两个孩子抚养权的归属主要依据《中华人民共和国民法典》婚姻家庭编的相关规定，以最有利于未成年子女的原则进行判决。
对于不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。这是因为这个阶段孩子通常更依赖母亲的照顾，母亲的生理和心理特点更适合照顾年幼子女。但如果母亲存在患有久治不愈的传染性疾病或者其他严重疾病，子女不宜与其共同生活；有抚养条件不尽抚养义务，而父亲要求子女随其生活等情形，父亲请求直接抚养的，人民法院会予以支持。
已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。法院会综合考虑双方的经济状况、生活环境、教育背景、道德品质等因素。例如，一方有稳定的收入、良好的居住条件和教育资源，能够为孩子提供更好的成长环境，那么在争取抚养权时会更有优势。如果一方存在赌博、吸毒等不良嗜好，或者有暴力倾向等不利于孩子成长的因素，法院可能会倾向于将孩子判给另一方。
子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。这个年龄段的孩子已经有了一定的认知和判断能力，他们的意愿在抚养权归属的判决中会起到重要作用。
如果父母双方抚养子女的条件基本相同，双方均要求直接抚养子女，但子女单独随祖父母或者外祖父母共同生活多年，且祖父母或者外祖父母要求并且有能力帮助子女照顾孙子女或者外孙子女的，可以作为父或者母直接抚养子女的优先条件予以考虑。
在实际情况中，如果双方都想要两个孩子的抚养权，或者都不想要孩子抚养权，法院会根据具体情况进行调解或判决。有时法院也会考虑将两个孩子分别判给父母双方，这样既能让孩子感受到父母双方的关爱，也能平衡双方的抚养压力。一切都是以保障孩子的健康成长为出发点。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》 第一千零八十四条
父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。
离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。
离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。
