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公司合并办理流程主要包括董事会制订合并方案、签订合并协议、编制资产负债表及财产清单、作出合并决议、通知债权人、进行合并登记等步骤。
首先是董事会制订合并方案。董事会作为公司的经营决策机构，需要对公司合并的可行性、方式、具体条款等进行详细研究和规划，形成初步的合并方案。该方案应涵盖合并各方的基本情况、合并的形式（如吸收合并或新设合并）、合并的条件、合并后公司的组织架构等重要内容。
接着是签订合并协议。在董事会制订的合并方案基础上，合并各方就合并的具体事宜进行协商并达成一致意见，签订合并协议。合并协议应当明确约定合并各方的权利和义务，如债权债务的承接、资产的处置、员工的安置等事项。
然后是编制资产负债表及财产清单。合并各方需要对自身的资产和负债状况进行全面清查和统计，编制详细的资产负债表和财产清单。这有助于合并各方准确了解彼此的财务状况，为合并决策提供依据，同时也便于在合并过程中对资产和负债进行合理的处置和分配。
之后是作出合并决议。公司合并属于重大事项，需要根据公司章程的规定，由股东会或股东大会作出合并决议。有限责任公司需经代表三分之二以上表决权的股东通过，股份有限公司需经出席会议的股东所持表决权的三分之二以上通过。
再之后是通知债权人。公司应当自作出合并决议之日起十日内通知债权人，并于三十日内在报纸上公告。债权人自接到通知书之日起三十日内，未接到通知书的自公告之日起四十五日内，可以要求公司清偿债务或者提供相应的担保。
最后是进行合并登记。公司合并完成后，需要依法向公司登记机关办理相应的登记手续。吸收合并的，被吸收的公司办理注销登记，存续公司办理变更登记；新设合并的，合并各方均办理注销登记，新设立的公司办理设立登记。
法律依据：
《中华人民共和国公司法》 第一百七十二条
公司合并可以采取吸收合并或者新设合并。
一个公司吸收其他公司为吸收合并，被吸收的公司解散。两个以上公司合并设立一个新的公司为新设合并，合并各方解散。
第一百七十三条
公司合并，应当由合并各方签订合并协议，并编制资产负债表及财产清单。公司应当自作出合并决议之日起十日内通知债权人，并于三十日内在报纸上公告。债权人自接到通知书之日起三十日内，未接到通知书的自公告之日起四十五日内，可以要求公司清偿债务或者提供相应的担保。
