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司法伤残鉴定费用一般由申请人预先垫付，最终根据不同情况确定承担方，可能由申请人自行承担、侵权方承担、败诉方承担等。
在司法实践中，司法伤残鉴定费用的承担需要区分不同情形。
如果是在民事诉讼中，通常遵循“谁主张，谁负担”的原则。即申请伤残鉴定的一方需要先垫付鉴定费用。例如在人身损害赔偿纠纷案件中，受害者为了确定自身伤残等级以主张相应赔偿而申请鉴定，此时受害者要先支付鉴定费用。
若最终鉴定结果对申请人有利，且责任明确由侵权方承担，那么鉴定费用通常会由侵权方承担。比如在交通事故中，经交警认定对方负全部责任，受害者申请伤残鉴定，鉴定后确定了伤残等级，那么该鉴定费用会由肇事方承担。因为侵权行为导致受害者需要进行鉴定来确定损失，让侵权方承担鉴定费用符合公平原则。
在一些案件中，如果经过法院审理判决，一方败诉，那么鉴定费用可能会由败诉方承担。法院会根据案件的具体情况，综合考虑双方的过错程度、责任划分等因素，来决定鉴定费用的最终承担者。
在刑事诉讼中，对于被害人因犯罪行为而导致的伤残鉴定，一般由司法机关承担鉴定费用。这是因为司法机关有职责查明案件事实，保障被害人的合法权益，进行伤残鉴定是查明案件事实的重要环节。
此外，如果是工伤认定中的伤残鉴定，根据相关规定，初次伤残鉴定的费用，用人单位为工伤职工购买了工伤保险的，由工伤保险基金支付；用人单位没有为工伤职工购买工伤保险的，由用人单位承担。再次鉴定的费用，鉴定结论与初次鉴定结论一致的，鉴定费用由申请方承担；鉴定结论与初次鉴定结论不一致的，鉴定费用由工伤保险基金支付。
法律依据：
《司法鉴定程序通则》 第二条
司法鉴定是指在诉讼活动中鉴定人运用科学技术或者专门知识对诉讼涉及的专门性问题进行鉴别和判断并提供鉴定意见的活动。司法鉴定程序是指司法鉴定机构和司法鉴定人进行司法鉴定活动的方式、步骤以及相关规则的总称。
《司法鉴定程序通则》 第八条
司法鉴定收费执行国家有关规定。
