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控股股东和实际控制人主要区别在于概念、对公司控制权的表现形式及认定标准上。控股股东强调股份占比优势带来的控制力；实际控制人则侧重于实际对公司经营决策等方面的控制能力，并不一定持有公司股份。
概念不同：控股股东是指其出资额占有限责任公司资本总额百分之五十以上或者其持有的股份占股份有限公司股本总额百分之五十以上的股东；出资额或者持有股份的比例虽然不足百分之五十，但依其出资额或者持有的股份所享有的表决权已足以对股东会、股东大会的决议产生重大影响的股东。实际控制人，是指虽不是公司的股东，但通过投资关系、协议或者其他安排，能够实际支配公司行为的人。
对公司控制权的表现形式：控股股东对公司的控制主要基于其所持有的大量股份，通过在股东（大）会上行使表决权来影响公司的重大决策，如选举董事、审批重大投资计划等。而实际控制人并不单纯依靠股权，可能通过协议安排、人事任免、对关键资源的掌控等方式来实现对公司经营管理的实际控制。例如，某些情况下，实际控制人可能通过与其他股东签订一致行动协议，联合行使表决权，从而控制公司决策。
认定标准上的差异：控股股东的认定相对直观，主要依据股权比例和表决权的行使对公司决策的影响程度。而实际控制人的认定则较为复杂，需要综合考虑多种因素。在司法实践和监管审查中，会考量诸如是否能够决定公司的经营方针和投资计划、是否能任免公司的高级管理人员、是否对公司的财务决策有重大影响力等多方面情况来判断是否存在实际控制人以及实际控制人的归属。
法律责任承担方面：控股股东基于其股东身份，在出资范围内对公司债务承担有限责任，同时要遵守公司法规定的股东义务，如不得滥用股东权利损害公司利益等。而实际控制人虽然不是股东，但如果因其不当行为导致公司或其他股东利益受损，也可能需要承担相应的法律责任，不过其责任的认定和承担往往需要结合具体的控制方式和损害后果来确定。
法律依据：
《中华人民共和国公司法》 第三十四条
股东按照实缴的出资比例分取红利；公司新增资本时，股东有权优先按照实缴的出资比例认缴出资。但是，全体股东约定不按照出资比例分取红利或者不按照出资比例优先认缴出资的除外。
《中华人民共和国公司法》 第四条
公司股东依法享有资产收益、参与重大决策和选择管理者等权利。
