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在机动车同等责任情况下，赔偿一般先由双方的交强险在责任限额内进行赔偿，超出交强险的部分，由双方按照50%的比例分担责任；若一方或双方还投保了商业三者险，则由商业三者险按合同约定进行赔偿。
交强险是机动车必须投保的强制保险，其具有先行赔付的特点。在双方机动车都投保了交强险的情况下，当发生交通事故且负同等责任时，各自的保险公司会在交强险责任限额内对对方的损失进行赔偿。交强险的责任限额分为死亡伤残赔偿限额、医疗费用赔偿限额和财产损失赔偿限额。例如，死亡伤残赔偿限额为18万元，医疗费用赔偿限额为1.8万元，财产损失赔偿限额为2000元。也就是说，如果一方的死亡伤残、医疗费用或财产损失在上述限额范围内，对方的交强险保险公司应进行全额赔偿。
如果双方的损失超出了交强险的赔偿限额，那么超出部分就要根据双方的责任比例来分担。因为是同等责任，通常双方各自承担50%的赔偿责任。比如，一方的车辆维修费用为5000元，对方交强险财产损失赔偿限额赔偿2000元后，剩余的3000元，双方各自承担1500元。
若机动车还投保了商业三者险，在交强险赔偿后，对于超出部分，商业三者险会按照保险合同的约定进行赔偿。商业三者险的赔偿金额取决于保险合同约定的保额以及具体的保险条款。比如，一方投保了50万元的商业三者险，在交强险赔偿后，其应承担的赔偿责任在商业三者险保额范围内，那么商业三者险会进行相应赔偿。
最后，如果双方中有一方未投保交强险，那么未投保方要在交强险责任限额内先承担赔偿责任，超出部分再按照同等责任的比例分担。总之，在机动车同等责任的赔偿问题上，要综合考虑交强险、商业三者险以及双方的实际损失情况来确定最终的赔偿方案。
法律依据：
《中华人民共和国道路交通安全法》 第七十六条
机动车发生交通事故造成人身伤亡、财产损失的，由保险公司在机动车第三者责任强制保险责任限额范围内予以赔偿；不足的部分，按照下列规定承担赔偿责任：
（一）机动车之间发生交通事故的，由有过错的一方承担赔偿责任；双方都有过错的，按照各自过错的比例分担责任。
（二）机动车与非机动车驾驶人、行人之间发生交通事故，非机动车驾驶人、行人没有过错的，由机动车一方承担赔偿责任；有证据证明非机动车驾驶人、行人有过错的，根据过错程度适当减轻机动车一方的赔偿责任；机动车一方没有过错的，承担不超过百分之十的赔偿责任。
交通事故的损失是由非机动车驾驶人、行人故意碰撞机动车造成的，机动车一方不承担赔偿责任。
