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起诉后借条原件需提交给受理案件的人民法院，法院接收后会出具正式收据。案件审结（包括判决、调解或撤诉）后，当事人可凭收据申请取回原件，但若原件需作为案卷材料归档，法院会在收据中注明留存情况。
根据《中华人民共和国民事诉讼法》第六十六条规定，证据应当提交原件。借条作为借贷关系的核心证据，其原件直接影响借贷事实的认定，起诉时需随起诉状一并提交法院。这是因为复印件或照片可能存在篡改风险，无法单独作为认定事实的依据，而原件是证明借贷关系真实性、合法性的关键载体。
法院接收借条原件时，会严格按照法定程序操作。当事人提交原件后，必须要求法院出具《证据材料收据》，收据需注明证据名称（如“借条”）、页数、份数、原件/复印件状态及接收日期，并由接收人员签名或盖章。该收据是当事人日后取回原件或主张权利的重要凭证，务必妥善保管。
在诉讼过程中，借条原件具有不可替代的作用。庭审质证环节，对方当事人有权核对原件，法院也需通过原件审查借条的笔迹、签章、内容完整性等，确认其是否存在伪造、涂改等情形。若仅提交复印件，而对方对真实性提出异议，又无法提供原件核对，可能导致法院对借贷事实不予认定，承担举证不能的法律后果。
案件审结后，借条原件的取回需遵循法院档案管理规则。一般情况下，判决生效后当事人可凭收据申请取回原件，法院核实后将原件退还；若案件以调解方式结案，且调解书内容明确“借条原件由法院附卷存档”，则原件可能随案卷归档，不再退还，但当事人可凭调解书和收据查询案卷副本。需注意，简易程序案件的归档流程可能更快，普通程序案件归档周期较长，建议结案后及时与承办法官或书记员沟通取回事宜。
若出现借条原件在法院保管期间丢失的特殊情况，当事人可凭《证据材料收据》向法院主张权利。根据《人民法院工作人员处分条例》相关规定，法院对接收的证据材料负有保管义务，因保管不当导致原件丢失的，当事人可要求法院出具证明文件，或通过国家赔偿程序维护权益。
实操中，建议当事人在提交原件前，自行复印或扫描留存复印件、电子版，并在复印件上注明“与原件核对无异”及提交日期，以备诉讼过程中查阅。同时，《证据材料收据》需详细注明“借条原件1份，金额XX元，出具日期XX”等关键信息，避免模糊表述。案件生效后，应在30日内联系法院申请取回原件，避免因案卷归档后调取流程繁琐。
法律依据：
《中华人民共和国民事诉讼法》 第六十七条
当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。
当事人及其诉讼代理人因客观原因不能自行收集的证据，或者人民法院认为审理案件需要的证据，人民法院应当调查收集。
人民法院应当按照法定程序，全面地、客观地审查核实证据。
《中华人民共和国民事诉讼法》 第六十九条
人民法院收到当事人提交的证据材料，应当出具收据，写明证据名称、页数、份数、原件或者复印件以及收到时间等，并由经办人员签名或者盖章。
