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环境损害赔偿的诉讼时效是三年，自当事人知道或者应当知道其受到损害时起计算。
根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。而《中华人民共和国环境保护法》第六十六条明确规定，提起环境损害赔偿诉讼的时效期间为三年，从当事人知道或者应当知道其受到损害时起计算。
这一特殊诉讼时效的规定，主要是考虑到环境损害案件本身的特点。环境损害往往具有潜伏性、缓发性和累积性等特征，损害结果可能不会立即显现出来。例如，某些环境污染可能在排放污染物后的数年甚至数十年后才导致明显的损害后果，如长期暴露在受污染的土壤或水源中引发的疾病。如果按照普通诉讼时效的起算点和时长，可能会使受害者在发现损害时已经超过诉讼时效，从而无法通过法律途径获得赔偿。
同时，在实际的环境损害赔偿诉讼中，时效的计算起点“知道或者应当知道其受到损害”需要根据具体情况进行判断。“知道”是指当事人明确知晓自己受到了环境损害以及损害与污染行为之间的关联。“应当知道”则是一种基于客观情况的推定，即根据一般人的认知能力和当时的实际情况，当事人有合理的理由应当察觉到自己受到了损害。
不过，需要注意的是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。这体现了法律在保障受害者权益的同时，也需要平衡司法资源的合理利用和社会秩序的稳定。
法律依据：
《民法典》 第一百八十八条
向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
