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要离婚且已分居两年，协议离婚最快。但前提是双方就离婚相关事宜，如子女抚养、财产分割、债务处理等达成一致意见。若无法达成一致，则只能通过诉讼离婚。
首先来了解协议离婚的流程和优势。协议离婚是指夫妻双方自愿离婚，并签订书面离婚协议，然后共同到婚姻登记机关申请离婚登记。根据《中华人民共和国民法典》规定，自婚姻登记机关收到离婚登记申请并向当事人发放《离婚登记申请受理回执单》之日起三十日内，任何一方不愿意离婚的，可以持本人有效身份证件和《离婚登记申请受理回执单》，向受理离婚登记申请的婚姻登记机关撤回离婚登记申请，并亲自填写《撤回离婚登记申请书》。经婚姻登记机关核实无误后，发给《撤回离婚登记确认单》，并将《离婚协议书》《离婚登记申请书》《撤回离婚登记申请书（联）》等一并存档。自离婚冷静期届满后三十日内，双方未共同到婚姻登记机关申请发给离婚证的，视为撤回离婚登记申请。一旦冷静期和相关程序顺利完成，双方就能较快拿到离婚证，整个过程相对诉讼离婚更为简便快捷。
而诉讼离婚则相对复杂。虽然分居两年可能是法院认定夫妻感情破裂的一个因素，但在诉讼过程中，需要向法院提交相关证据证明分居的事实和时间，比如分居协议、租房合同、居委会证明等。法院在审理离婚案件时，会先进行调解，调解无效且认定夫妻感情确已破裂的，才会准予离婚。整个诉讼过程可能会经历立案、审理、判决等多个阶段，时间周期较长，少则几个月，多则可能一年甚至更久。
综上所述，如果已分居两年想要快速离婚，在双方能够协商一致的情况下，选择协议离婚是最优解。但如果双方存在较大争议，无法协商，那么只能通过诉讼离婚，借助法律途径来解决离婚问题。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》 第一千零七十六条
夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。
《中华人民共和国民法典》 第一千零七十七条
自婚姻登记机关收到离婚登记申请之日起三十日内，任何一方不愿意离婚的，可以向婚姻登记机关撤回离婚登记申请。
前款规定期限届满后三十日内，双方应当亲自到婚姻登记机关申请发给离婚证；未申请的，视为撤回离婚登记申请。
