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分居两年且有财产纠纷是可以离婚的。离婚与是否存在财产纠纷并无直接关联，分居两年符合法定离婚情形时，可通过诉讼离婚；也可以选择协议离婚，即使有财产纠纷，只要双方能就财产分割等问题达成一致，同样能办理离婚手续。
在我国，离婚有协议离婚和诉讼离婚两种方式。
协议离婚方面，依据《中华人民共和国民法典》第一千零七十六条规定，夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。所以，即便存在财产纠纷，只要夫妻双方能够心平气和地坐下来，就财产分割问题达成一致，签订好离婚协议，就可以前往婚姻登记机关办理离婚登记手续。这种方式相对简便、快捷，能和平地结束婚姻关系。
诉讼离婚方面，根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条规定，夫妻因感情不和分居满二年，调解无效的，应当准予离婚。当夫妻分居两年且无法就财产纠纷协商一致时，任何一方都有权向人民法院提起离婚诉讼。在诉讼过程中，法院首先会对双方进行调解，如果调解无效，且能认定夫妻感情确已破裂，同时满足因感情不和分居满两年这一条件，法院会判决准予离婚。对于财产纠纷，法院会根据法律规定和实际情况进行审理和判决。例如，会遵循照顾子女、女方和无过错方权益的原则，对夫妻共同财产进行合理分割。
综上所述，分居两年且有财产纠纷并不影响离婚的进行，夫妻可以根据自身情况选择合适的离婚方式来解决婚姻问题和财产纠纷。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》 第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
