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小规模纳税人和一般纳税人在认定标准、税率与征收率、计税方法、发票使用等方面存在明显区别。
在认定标准上，根据相关规定，年应征增值税销售额500万元及以下的为小规模纳税人，超过该标准的则一般认定为一般纳税人。不过，会计核算健全、能够提供准确税务资料的小规模纳税人，也可以向主管税务机关办理一般纳税人登记。
税率与征收率方面，一般纳税人适用的税率有13%、9%、6%以及零税率等，不同的行业和业务适用不同的税率。而小规模纳税人采用征收率，通常为3%，在2023年期间，适用3%征收率的应税销售收入，减按1%征收率征收增值税；销售不动产等业务的征收率为5%。
计税方法上，一般纳税人采用一般计税方法，应纳税额=当期销项税额-当期进项税额。销项税额是按照销售额和适用税率计算，进项税额则是购进货物、劳务、服务等取得的合法扣税凭证上注明或计算的税额。小规模纳税人采用简易计税方法，应纳税额=销售额×征收率，不存在抵扣进项税额的情况。
发票使用也有差异，一般纳税人可以自行开具增值税专用发票和普通发票。专用发票不仅是商事凭证，还具有抵扣税款的功能。小规模纳税人通常只能开具增值税普通发票，但现在小规模纳税人也能自行开具增值税专用发票。不过，部分业务需要到税务机关代开专票。
税收优惠政策上，小规模纳税人有较多针对其特点的优惠政策。比如月销售额10万元以下（季度销售额30万元以下）免征增值税。而一般纳税人则没有此类普惠性的免征增值税优惠，但在一些特定行业和项目上有相应的税收优惠，如软件企业的即征即退政策等。
法律依据：
《中华人民共和国增值税暂行条例》 第二条
增值税税率：
（一）纳税人销售货物、劳务、有形动产租赁服务或者进口货物，除本条第二项、第四项、第五项另有规定外，税率为17%。
（二）纳税人销售交通运输、邮政、基础电信、建筑、不动产租赁服务，销售不动产，转让土地使用权，销售或者进口下列货物，税率为11%：
1．粮食等农产品、食用植物油、食用盐；
2.自来水、暖气、冷气、热水、煤气、石油液化气、天然气、二甲醚、沼气、居民用煤炭制品；
3．图书、报纸、杂志、音像制品、电子出版物；
4．饲料、化肥、农药、农机、农膜；
5．国务院规定的其他货物。
（三）纳税人销售服务、无形资产，除本条第一项、第二项、第五项另有规定外，税率为6%。
（四）纳税人出口货物，税率为零；但是，国务院另有规定的除外。
