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怀孕时离婚，小孩出生后一般归母亲直接抚养。但存在特殊情况时，也可能由父亲抚养。
在法律层面，对于孩子抚养权归属有明确的规定和考量因素。根据《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条规定，离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。怀孕之后离婚，孩子出生后通常在两周岁以内，所以正常情况下是由母亲直接抚养。这主要是考虑到婴儿对母亲在生理和情感上的依赖，母亲在这个阶段更能给予孩子所需的照顾和关爱，有利于孩子的健康成长。
不过，也存在一些特殊情况会导致抚养权归属父亲。如果母亲有下列情形之一，父亲请求直接抚养的，人民法院会予以支持。一是母亲患有久治不愈的传染性疾病或者其他严重疾病，子女不宜与其共同生活。例如母亲患有严重的肺结核等传染病，继续由母亲抚养可能会对孩子的健康造成威胁。二是母亲有抚养条件不尽抚养义务，而父亲要求子女随其生活。比如母亲对孩子不管不顾，不履行照顾孩子生活、教育等抚养义务。三是因其他原因，子女确不宜随母亲生活。例如母亲存在吸毒、赌博等不良行为，不适合抚养孩子。
父母双方也可以通过协议的方式来确定孩子的抚养权。如果双方能就孩子抚养问题达成一致意见，且该协议不违反法律规定，不损害孩子的合法权益，那么按照协议执行。在确定抚养权时，法院始终会以最有利于未成年子女的原则进行判决，会综合考虑父母双方的抚养能力、抚养条件、孩子的生活环境等多方面因素。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》 第一千零八十四条
父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。
离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。
离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。
