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兄弟姐妹户口不在一起时，可通过出生证明、户籍档案、亲属关系公证书、单位或社区证明等方式证明亲属关系。
在实际生活中，当兄弟姐妹户口不在一起需要证明亲属关系时，有多种途径可以尝试。
出生证明：出生证明是证明亲属关系的重要材料。如果能够找到双方的出生证明，且上面清晰记录了父母信息，就可以以此证明兄弟姐妹关系。因为出生证明是由医院等权威机构开具，具有较高的证明效力。
户籍档案：可以前往原户籍所在地的派出所查询户籍档案。在户籍迁移过程中，原户籍档案可能会保留家庭成员的相关信息，包括兄弟姐妹关系。派出所会根据档案记录开具相应的证明。不过，由于时间久远等原因，档案可能存在信息不完整或难以查找的情况。
亲属关系公证书：申请亲属关系公证书也是一种常见的方式。需要准备相关材料，如身份证、户口本、可能有的出生证明等，前往公证处办理。公证机构会对提供的材料进行审查核实，之后出具具有法律效力的亲属关系公证书。这种证明在很多场合都被广泛认可。
单位或社区证明：如果出生证明等难以获取，也可以由兄弟姐妹工作单位或居住的社区开具证明。单位或社区通常对居民情况有一定了解，会根据实际情况进行调查后出具证明。不过这类证明的效力相对较弱，可能需要其他材料进行佐证。
还可以通过亲子鉴定来证明兄弟姐妹关系，但这通常是在其他方法无法证明且有必要的情况下才会采用，因为亲子鉴定涉及费用和隐私等方面的问题。要根据具体情况选择合适的方式来证明亲属关系。
法律依据：
《中华人民共和国户口登记条例》 第十七条
户口登记的内容需要变更或者更正的时候，由户主或者本人向户口登记机关申报；户口登记机关审查属实后予以变更或者更正。
户口登记机关认为必要的时候，可以向申请人索取有关变更或者更正的证明。
