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自建房不动产权证一般不存在年限到期问题，若涉及土地使用年限到期，住宅用地通常会自动续期，非住宅用地需提前一年申请续期，经批准后重新签订土地出让合同，支付土地出让金，再办理相关手续。
首先要明确，自建房不动产权证包含房屋所有权和土地使用权两方面。房屋所有权是永久的，不存在年限到期的情况。而土地使用权是有期限的，不同用途的土地使用年限不同，例如居住用地是70年，工业用地、教育、科技、文化、卫生、体育用地等是50年，商业、旅游、娱乐用地是40年。
对于住宅用地的自建房，依据《民法典》规定，住宅建设用地使用权期限届满的，自动续期。自动续期意味着不需要房主主动提出申请，相关部门会按照规定进行续期操作。不过目前对于自动续期是否需要缴纳费用以及缴纳标准等具体细则，还没有明确的法律规定。
如果是商业、工业等非住宅用地的自建房，土地使用年限到期后，根据《城市房地产管理法》，土地使用者需要提前一年向土地管理部门提出续期申请。土地管理部门会根据社会公共利益的需要，决定是否批准续期申请。
若获得批准续期，土地使用者要重新签订土地出让合同，并按照规定支付土地出让金。之后，凭借新的土地出让合同、缴费凭证等相关文件，到不动产登记机构办理不动产权证书的变更登记手续，换发新的不动产权证书，以确认新的土地使用期限。
要是土地管理部门因公共利益等原因不批准续期，土地使用权将由国家无偿收回。但对于土地上的房屋及其他不动产，会按照相关法律法规给予相应补偿。
法律依据：
《中华人民共和国城镇国有土地使用权出让和转让暂行条例》 第十二条
土地使用权出让最高年限按下列用途确定：
1、居住用地70年；
2、工业用地50年；
3、教育、科技、文化、卫生、体育用地年限为50年；
4、商业、旅游、娱乐用地40年；
5、仓储用地50年；
6、综合或者其他用地50年。
《中华人民共和国民法典》 第三百五十九条
住宅建设用地使用权限期间届满的，自动续期。非住宅建设用地使用权期间届满后的续期，依照法律规定办理。该土地上的房屋及其他不动产的归属，有约定的，按照约定；没有约定或者约定不明确的，依照法律、行政法规的规定办理。
